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Des virus connus contiennent-ils des informations génomiques « indésirables » ou parasitaires ?

Des virus connus contiennent-ils des informations génomiques « indésirables » ou parasitaires ?


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Après avoir lu sur les soi-disant «protéines mystères» dans cet excellent résumé du génome du coronavirus (et reconnaissant que le «mystère» reflète simplement notre manque de connaissances sur un tout nouveau virus), je suis curieux de savoir si des virus connus peuvent contenir des parasites l'information génétique "le long du trajet", ou si leurs génomes sont sélectionnés, de manière générale, pour être aussi efficaces que possible sur le plan informationnel, pour quoi est-il codé ? En d'autres termes, la pression de sélection permet-elle à ces parasites de contenir leurs propres parasites, et en existe-t-il des exemples connus, si oui ?


Je suis curieux de savoir si des virus connus peuvent contenir des informations génétiques parasitaires "le long du trajet"

Analogue aux transposons parasites mentionnés dans l'article lié par canadien, îlots chromosomiques inductibles par les phages sont des éléments mobiles qui "détournent" la machinerie moléculaire du bactériophage lors d'une infection lytique d'hôtes Gram-négatifs. Les éléments PICI, comme on les appelle, codent pour les protéines Rpp qui se complexent avec l'homodimère du phage TerS, modifiant la conformation du complexe de telle sorte que le PICI car mimic est préférentiellement lié et conditionné dans la capside vide. Fillol-Salom et al. 2019 1 discuter en détail du mécanisme de propagation PICI et fournir un bon résumé graphique du processus :

Des éléments similaires existent dans les bactéries Gram-positives, en particulier Staphylococcus aureus, appelé Staphylococcus aureus îlots de pathogénicité (SaPI). Au lieu de coder pour une protéine distincte qui se complexe avec le phage TerS, les SaPI codent pour un homologue de TerS qui reconnaît et emballe spécifiquement l'ADN de SaPI dans les capsides du phage.2

Notez que cette réponse n'aborde pas directement la question de l'ADN « poubelle » dans les virus, car les éléments PICI sont dormants dans les génomes des hôtes bactériens plutôt que dans les génomes des virus eux-mêmes. Cependant, je pense que cela est pertinent dans la mesure où ils parasitent les bactériophages et sont donc « accompagnés » dans la capside virale.


Citations

  1. Piratage des pirates de l'air : Escherichia coli Pathogenicity Islands Rediriger l'emballage de phages auxiliaires à leur propre avantage
  2. Rôle du phage staphylococcique et de l'intégrase SaPI dans le transfert intra et interspécifique de SaPI


Voir la vidéo: viirus (Mai 2022).